光动力治疗中的激光照射，只起激活光敏剂的作用，能量无需太集中，不会造成照射区的明显温升，更不会造成组织的热损伤。而通常的激光手术，则是利用高能激光束所产生的局部高温，来切割、汽化或凝固病变组织，所以光动力疗法和传统的激光手术有本质的区别，光动力治疗是一种光化学反应诱导的生物化学作用过程，而激光手术是一种单纯的物理作用过程。